Dans le domaine vétérinaire, l’autovaccin s’inscrit dans une démarche de recherche de solutions palliatives aux antibiotiques, dans une perspective de mise sur le marché de produits animaux sains, tant sur le plan des contaminations bactériennes que de l’absence de résidus médicamenteux. Il permet, dans le domaine des vaccins destinés aux animaux, de répondre à l’absence de solution vaccinale à des pathologies spécifiques ou à des espèces animales «mineures» ne présentant pas un marché susceptible d’intéresser les laboratoires à vocation internationale. Il permet d’apporter une réponse personnalisée à une pathologie spécifique d’un élevage.